一、 本署依據「行政院國土安全政策會報設置及作業要點」，主責「海事重大人為危安或恐怖攻擊應變事宜」。

二、 為強化反恐能量，本署研訂「反海事恐怖攻擊應變計畫」，成立特種勤務隊，執行海域、岸際打擊犯罪能量，平時分派至空勤總隊支援空中偵巡及救難任務，變時則執行海空聯合打擊海上犯罪。

三、 每2年辦理「海安演習」實施驗證。