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　　為因應全球氣候變遷帶來的極端降雨、水患及土石流等極大規模複合型災害，並配合政府災防政策之革新，本署除執行海難搜救之法定任務，並於颱風來襲時勸離岸際公告警戒區內觀浪戲水民眾，更須掌握全般救災能量，積極投入各項防災及救災、復原等工作，於國內發生重大災難時，立即動員能量投入整體應變救災體系協助救災，以發揮政府一體之整體防救災效能。

(1)2009年莫拉克風災期間本署執行海難搜救部分救起107 人、成功保護5 船進港或脫困；協助內陸救災部分營救受困災民618 人、運送或發放救災物資96 趟及協助清理災民家園18 處。

(2)2010年於凡那比、梅姬颱風期間救援（含撤離）239人、運送物資1000份及災後復原22處。

(3)2011年計執行「艾利」、 「桑達」、「米雷」、「梅花」及「南瑪都」等颱風災害應處，並依各地方政府之請求，調派相關搜救能量投入救災。重要執行成果為本署於「南瑪都」颱風期間協助疏散民眾48人與清理家園，及執行巴拿馬籍「奮進3號（MAYU YA3）」油輪(總噸位約6,000、船上20人、約有60噸燃油)失去動力擱淺救援案。

(4)2012年「天秤颱風」侵襲期間，本署東沙指揮部同仁不畏強風暴雨，奮力救援因颱風擱淺之澎湖籍「得財富」漁船，成功救起7名船員；並幫助屏東受災地區如恆春鎮、車城鄉等地災民清理家園，以及運送救援物資至蘭嶼。

梅姬颱風期間，協助蘇澳鎮進行災後復原工作

天秤颱風侵台後，協助恆春鎮災後重建工作