一、我國海難災害搶救實務運作方式，係依海難發生地點，由其所屬管理機關擔任現場指揮任務。於港口（包括商港、漁港、軍港、工業專用港）區域內所發生之海難，現場指揮官由各港口管理機關(單位)首長(負責人)，或其指派人員應變指揮；港口區域以外之海上救難之現場指揮由海巡單位擔任。倘發生重大海難案件，政府即成立海難中央災害應變中心，並由應變中心指揮官視搜救實際情況，指派適當單位或人員擔任現場指揮官，負責指揮、協調與整合各單位協同救災。

二、我國海難搜救作業主要由行政院國家搜救指揮中心負責通報與協調，本署、內政部空中勤務總隊、國軍等相關單位執行。當本署接獲海難事件通報後，即依「海岸巡防機關執行海上救難作業程序」相關規定展開救援行動。

三、本署於接獲海難事件通報後，於第一時間指揮、調派艦艇、人員前往救援，並橫向聯繫相關單位共同協助處理。