9月7日7時27分，第六巡防區指揮部接獲118報案：稱於臺南北門區雙春濱海沙灘有1隻鯨豚擱淺；8時12分，本署人員抵達現場，經國立成功大學海洋生物暨鯨豚研究中心王教授初步判斷該品種為「小抹香鯨」，期間本署人員嘗試將鯨豚往大海方向移動未果，14時10分，確認鯨豚已死亡（無呼吸心跳與眼瞼反射），續於16時20分，將鯨豚吊掛至車上並運往成大生物研究中心進行病理解剖等後續作業。