艦隊分署每年9月至隔年3月東北季風期間，均規劃西北護漁專案勤務，以每日編排1艦1艇執勤為原則，並適時執行擴大威力掃蕩勤務。若大陸與本國漁船發生漁事糾紛，海巡艦艇也會立即採取強制登檢的執法作為，要求陸船賠償國籍漁船損失。