一、本署執行上開執法過程未能蒐證乙節，外界質疑隱匿影片並非事實
(一)本案執法過程中因高速追逐狀況，船身受海浪影響劇烈晃動，同仁須高度專注維持平衡，加以本案發生僅歷時五分鐘，故因高速追逐及時間短暫等因素，致該名負責蒐證同仁未即拿取蒐證器材(手持式攝影機)進行蒐證。
(二)本案因未有全程蒐證影像，因此導致家屬無法很快地瞭解事實真相，沒能讓家屬能夠安心，也讓社會有很多爭議，我們感到抱歉，本署已積極配合檢方調查，相信司法機關之調查程序必定可還原事實，未來本署會將本案作為勤務上之精進，亦將加強相關教育訓練及律定作業程序。
(三)本署現有CP艇現無裝設全船監視系統，依據本署配備基準，是類小艇亦未配備密錄器，故同仁未使用密錄器，未違反相關規定，惟倘有密錄器使用，縱然無法拿取手持式攝影機，亦能避免本次無法蒐證的情況發生，故未來針對該型艇出勤時，將全數補足船上4名執勤同仁足額之密錄器。
二、本案取締該艘越界快艇為海巡署日常執法任務
(一)本案係雷達發現該陸籍快艇越界後，第十二巡防區即通知CP-1051艇前往實施取締，這是一個執法案件，春節前金門海域即有許多是類快艇在周邊海域作業，本署不斷接獲民眾報案，故必須依法取締，以符人民期待，故本案為執法作為，並無上級特別指示或其他考量，純屬海巡日常執法行動。
(二)為使大眾瞭解事件始末，本署特提供案發時該海巡艇與第十二巡防區之無線電通聯錄音檔。
三、本事件不幸造成兩名陸籍人員死亡，對於死者家屬的傷痛，我們同體大悲，亦不樂見其發生，本案已接受檢察官調查，希望全案回歸執法個案，不要升高衝突，更希望擱置政治，人道優先，我們期待能僅速完成善後，讓死者安息，生者安心。