據收復太平島之中業艦李敦謙艦長於《艱險定疆立奇功進駐南沙群島紀實》中記載(中外雜誌，382期，民國77年(1988年）)，民國35年(1946年)12月12日登太平島時，即發現「島之中央地點有清泉土井一口，水質清涼味美，正是我駐島人員飲用水之泉源」。嗣經歷年駐軍陸續擴充，迄民國89年(2000年)海巡署接替防務時已有10口水井，顯見地下水脈蘊藏豐富；原2、3、4號等3口井已於民國96年(2007年)間機場整建時填埋，另1、6、8號等3口井暫無使用，9號井僅養殖吳郭魚；餘5、7、10號等3口井目前正常使用中，另於104年12月12日將使用之水井由島東向島西重新編號。

 

　　南沙地區旱季為每年2月至6月；雨季為6月下旬至隔年1月；年平均降雨量為3,118.4毫米，每月平均259.9毫米，南沙指揮部目前運用餐廳屋頂承接雨水建置地下回收池（40公噸）及6座蓄水塔(17.5公噸)，另配合南沙交通基礎整建工程構建兩座蓄水池，約可蓄儲101,500公升（101.5公噸）雨水，主要供應灌溉使用。