一、依據《海岸巡防法》第5條第1項第1、2款規定：「巡防機關人員對進出通商口岸、非通商口岸之船舶及其載運物品，有正當理由，認有違法之虞時，得依法實施檢查」。
二、本署執行船舶載運物品，檢查流程如下：
(一)檢查前，會請船方或貨方人員陪同，不單獨實施檢查。
(二)檢查中，以不破壞貨物為原則，全程錄影或拍照存證。
(三)檢查後，會將貨箱復原，並於貨箱上黏貼驗訖貼紙(註記安檢單位與人員)及專用膠帶，以提供寄貨人或收件人查詢。
三、貨物運輸過程，尚有可能物件擠壓或摔傷，造成受損之虞，如查貨物損傷係本署安檢人員之責，可依相關規定辦理賠償事宜。