本分署設置分署長1人，副分署長2人及主任秘書1人，內部單位為巡防科、檢管科、後勤科、通電資訊科、督察科、勤指中心、秘書室、人事室及主計室。所屬單位為第一Ｏ岸巡隊、第九岸巡隊及第七岸巡隊。