| 編號 | 日期 | 歷年重大事紀 |
| 1. | 108/11/29 | 於本署全球資訊網「海洋保育」專區之成果專欄子專區，新增「取締違法大陸抽砂船成效」 |
| 2. | 108/10/05 | 配合海洋委員會海洋保育署，於本署轄屬崎頂雷達站，完成「海洋保育類野生動物救護中心」設置、救援講座及設備組裝訓練等事宜 |
| 3. | 108/06/24 | 配合海洋委員會海洋保育署辦理「彰化地區鯨豚緊急機動救援站」設置作業，現勘本署中部分署轄屬第四一岸巡中隊等單位 ，並擇定以該中隊為設置地點 |
| 4. | 108/05/31 | 配合海洋委員會海洋保育署辦理「海洋保育類野生動物救護中心」設置作業，現勘本署中部分署轄屬崎頂雷達站 ，並擇定以該處所為設置地點 |
| 5. | 108/05/22 | 「海洋保育行動－護永專案（海巡署）」粉絲專頁更名為「海巡署-藍色國土的守護者」，改以機關型態經營 |
| 6. | 108/01/02 | 於Google Map標誌臺灣白海豚生態紀錄地點 |
| 7. | 108/01/02 | 於本署全球資訊網「海洋保育」專區，新增「救援海洋野生動物」子專區，公開救援鯨鯊、海豚、綠蠵龜等海洋野生動物工作成效 |
| 8. | 107/07/17 | 於本署全球資訊網「海洋保育」專區，新增「臺灣白海豚復育」子專區，公開「生態紀錄」及「棲地範圍取締沿近海非法漁業成效」 |
| 9. | 107/07/05 | 召開「107年護永專案策進及展望研討會」 |
| 10. | 107/06/21 | 海洋保育專業諮詢機制移由海洋委員會海洋保育署銜接 |
| 11. | 107/06/21 | 「行政院海岸巡防署海洋環境保護及保育專業諮詢遴選要點」停止適用 |
| 12. | 107/06/20 | 研提「護永專案專題企劃－臺灣白海豚復育專案」 |
| 13. | 107/04/28 | 海洋事務專責機關海洋委員會及所屬海洋保育署成立 |
| 14. | 106/04/11 | 函頒「護永專案106年度推動工作重點」 |
| 15. | 106/02/22 | 召開「106年護永專案策進及展望研討會」 |
| 16. | 105/10/27 | 行政院海洋推動事務小組會議第16次會議報告專案工作推動情形 |
| 17. | 105/09/21 | 本署海洋保育網頁平台架設完成及上線 |
| 18. | 105/08/18 | 函頒「行政院海岸巡防署海洋環境保護及保育專業諮詢遴選要點」 |
| 19. | 105/07/16 | 全國同步淨灘活動 |
| 20. | 105/06/30 | 「海洋保育行動－護永專案（海巡署）」粉絲專頁正式上線 |
| 21. | 105/06/30 | 對外宣布計畫正式實施 |
| 22. | 105/06/27 | 函頒「海洋保育『臉書粉絲專頁』作業規定」 |
| 23. | 105/06/22 | 署長會晤海洋保育學者專家 |
| 24. | 105/06/22 | 舉辦「海洋保育動員計畫」諮詢座談會 |
| 25. | 105/06/17 | 函頒「用行動守護海洋資源─海洋保育動員計畫」 |
| 26. | 105/06/08 | 召開研商「用行動守護海洋資源－海洋保育動員細部執行計畫」 |
