業務職掌

　　依據行政院海洋委員會海巡署核心任務及本分署組織通則，主要掌理工作有：
一、海岸管制區之管制及安全維護事項。
二、入出港船舶或其他水上運輸工具之安全檢查事項。
三、海域、海岸、河口與非通商口岸之查緝走私、防止非法入出國、執行通商口岸人員之安全檢查及其他犯罪調查事項。
四、海域及海岸巡防涉外事務之協調、調查及處理事項。
五、走私情報之蒐集，滲透及安全情報之調查處理事項。
六、海洋事務研究發展事項。
七、執行事項：
　（一）海上交通秩序之管制及維護事項。
　（二）海上救難、海洋災害救護及海上糾紛之處理事項。
　（三）漁業巡護及漁業資源之維護事項。
　（四）海洋環境保護及保育事項。
八、其他有關海岸巡防之事項。
有關海域及海岸巡防國家安全情報部分，應受國家安全局之指導、協調及支援。