北部地區機動海巡隊為海巡署艦隊分署各機動海巡隊中,艦船數及人數最多的單位,本隊位於新北市八里區訊塘里6鄰厦竹圍7之9號。
管轄海域東自蘇澳港向外延伸至東經126度,西自新竹外海延伸至海峽中線,北至北緯29度18分(含西北海域、北方三島海域及釣魚台海域),所轄海域面積約為18萬1000平方公里。
本隊配置七艘大型巡防艦,分別為4000噸級新竹艦(海巡署現役最大型巡防艦)、3000噸級宜蘭艦、2000噸級新北艦、1000噸級桃園艦、600噸級淡水艦(海巡署現役航速最快巡防艦)、基隆艦及500噸級連江艦。
本隊主要執行本署五大核心任務中的「海域治安」、「救生救難」、「維護漁權」,為因應海域特性及季節漁汛期執行漁業巡護、海域秩序維護等勤務,除上述例行勤務外,亦配合執行特殊專案勤務、聯合擴大威力掃蕩越界大陸漁船等。
北部地區機動海巡隊為守護台灣北部海域門戶之重要單位,依據國家海洋政策「捍衛主權」、「維護漁權」及「確保海洋資源永續發展」,加強勤務作為以維護海域安全,為本隊責無旁貸的職責。