「南沙醫院」前身為南沙醫務所，於民國52年興建完成，為本島重要醫療場所，現由本署醫官、國軍高雄總醫院資深主治醫師及麻醉護理師等員編配駐診，並備有手術室、X光室及病房等醫療設施，以提供同仁完善醫療服務。

　　國軍高雄總醫院合作遠距離醫療系統，倘遇重大複雜病情，即透過系統與該院各專科醫師實施視訊會診，以協助駐島醫師現場處置，確保人員健康安全。為強化島區醫療服務，本署亦與南沙醫院服務的對象不只是島上駐島人員，本署基於海事服務、救生救難的職責，對附近海域作業之各國漁民亦施予人道醫療救助，本署自89年駐島迄今執行南沙海域國際人道救援共計14案15人次，另執行本國籍緊急救護共計18案19人次，合計32案34人次。